|
Personel CV`si Yazdır |
|
Personel CV`si Yazdır |
Ormeci L, Gursoy A, Tunca G, Erman B. "Computational Basis of Knowledge- Based Local and Long Range Conformational probabilities in Proteins"; Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Volume 66, Issue 1, Pages 29– 40 (2006) |
Modeling of HIV-1 Reverse Transcriptase Mutants: Effects of Mutation on Structure and Possible Relation to Function, Güzin Tunca, Xavier Daura, International Symposium on Health informatics and Bioinformatics (HIBIT), 18-20 Mayıs 2008, İstanbul, Türkiye (Poster) |
Molecular Docking for Designing Pharmacological Chaperones for Acid beta-Glucosidase, Güzin Tunca, Xavier Daura, ProtIst’10: Novel Approaches in Protein Engineering, 23-25 Nisan 2010, İstanbul, Türkiye (Poster) |
Sabancı Üniversitesi Başarı Bursu |
Koç Üniversitesi Yüksek Lisans Bursu |
İspanya Dışişleri Bakanlığı Doktora Araştırma Bursu |
Bu ders giriş seviyesinde Python dilini ve çeşitli modüllerini etkin olarak kullanabilme yetisini geliştirme ve bu dili kullanarak biyolojik problemleri çözme üzerine yoğunlaşmıştır.
Bu ders biyolojik sistemlerin bilgisayar yardımıyla incelenmesi ve biyolojik sistemler ve biyomühendislikte modelleme konularına yoğunlaşmıştır. Yeni nesil dizileme teknolojileri ve bilgisayarlı analizi konusunda bilgilendirmek, protein ve molekül görselleme ve modelleme araçlarının kullanımını öğretmek, Biyolojik veritabanlarının etkin kullanımını öğretmeyi amaçlamaktadır.
Bu dersin amacı moleküler biyoloji ve bilgisayar bilimlerinin buluştuğu disiplinlerarası bir bilim dalı olan biyoenformatik hakkında genel bir bakış sunmak, milyonlarca nükleotid ya da amino asitlerden oluşan dizileri sıradan bir kişisel bilgisayarda analiz edebilme ve sonrasında uygulanan analizler sayesinde biyolojik sistemlere ait yapı ve mekanizmanın açığa çıkartılması ile hastalıklara sebep olan mekanizmanın belirlenmesi ve tedavisinin mümkün kılınmasına giden yol haritasını göstermektir.
Bu ders ilaç tasarımında docking uygulamaları, skorlama fonksiyonları, ensemble docking teknikleri, sanal tarama, QSAR (Yapı-Aktivite Sayısal İlişkisi) ve farmakofor modelleme konularında bilgilendirmek; docking programı ve farmakofor modelleme araçları ile uygulamalı çalışmalar gerçekleştirmek üzerine yoğunlaşmıştır.