» Biyografi

Doç.Dr. Neşe Akış Sansa Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesinde (TÜTF) immünoloji alanında çalışan öğretim üyesidir. İmmünoloji PhD ünvanını 1996 yılında İstanbul Üniversitesinde (İÜ) kazandı. Doktoral çalışmasında endotel hücrelerin diyabetik stres etkenlerine karşı yanıtını inceledi. Doktora sonrası araştırmalarında UPenn ve ilişkili enstitülerde süren kısmi scid farelerde DNA-PKc mutasyonları (FCCC), anti-idyotipik kanser aşısı faz-1 çalışması (The Wistar Institute) ve nefritojenik endotelyal antijenler (İç Hastalıkları A.D., Nefroloji B.D) projelerine katıldı. Aktif çalışmaları arter-koruyucu genler ve Ikaros ailesi üyelerinin evrimi üzerine. Uzmanlaştığı araştırma araçları biyoinformatik, moleküler biyoloji (PCR, RT-qPCR, klonlama), hücresel teknikler (doku kültürü, akan hücre ölçer), immünokimya ve küçük deney hayvanları.

Dr. Akış 1980’de İÜ’den BChE derecesi ile mezun oldu ve 1985’e kadar endüstriyel laboratuvarlarda organik kaplayıcılar üzerine çalıştı. İstanbul Tıp Fakültesine (İTF) geçtikten sonra tıbbi immünoloji laboratuvarcılığı alanında deneyim kazandı, T hücre sitotoksisitesi ve MS lab tanısı üzerine The University of Birmingham’da ve ayrıca  komplementoloji ve labdaki tanısal uygulamalar üzerine The Institue of Enzymology-Budapest’de staj yaptı, ve İTF’de primer immün yetmezlikler tanı laboratuvarını kurdu. Bu süreçte, yüksek lisans tezinde Salmonella OMP antijenlerini araştırdı (1989) ve doktora öncesi araştırmasında anti-idyotipik HBV aşısı üzerine The Institut Pasteur-Paris’de staj yaptı. 2003 yılında öğretim üyesi kariyerine başladığı Haliç Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik A.D.’da (MBG) yeni dersler ve kendi araştırma programını başlattı. 2003-2005 arasında eş zamanlı olarak Boğaziçi Üniversitesi MBG’de lisans öğrencilerine insan fizyolojisi ve biyoinformatik dersleri verdi. 2006’da TÜTF’ye geçtikten sonra MD programı için dersler geliştirdi ve lisans üstü immünoloji programlarını kurdu. 2012-2013’de FAU Erlangen-N’de miRNA’lar üzerine çalışmalar yaptı. Değerli somut ürün olarak dört farklı anti-bradikinin antikoru (İÜ DETAM, 1996) ve lisanslanabilir üç farklı glomerüler hücre hattına (UPenn CTT TechID: O2748, 2002) sahip, yayınları 783 atıf aldı. YÖK’ten immünoloji doçentliği ve lise kimya öğretmenliği sertifikaları bulunmakta. TMMOB-KMO, TİD, ESM, EVBO, DGfI ve GEBIN üyesidir. 1991’de İTO’da Temel Tıbbi Bilimler Komisyonunu ve 1992’de KMO-İst Şb’de Temel Sağlık Bilimcileri Komisyonunu kurdu. 2012-2016’da TİD’in Eğitim Grubu başkanlığını yürüttü. https://unis.trakya.edu.tr/akademisyen/akisn

» Akademik ve İdari Görevler

» Yayınlar

SCI-SSCI, SCI Expanded ve AHCI Kapsamındaki Yayınları

  • Pawar RD, L Castrezana-Lopez, R Allam, OP Kulkarni, S Segerer, E Radomska, TN Meyer, CM Schwesinger, N Akis, HJ Gröne, HJ Anders, “Bacterial Lipopeptide Triggers Massive Albuminuria in Murine Lupus Nephritis By Activating Toll-like Receptor 2 at the Glomerular Filtration Barrier”, Immunology 128(1 Suppl):e206-21 (Ocak 2009)
    82
    ATIF
  • Ninichuk V, O Gross, S Segerer, R Hoffmann, E Radomska, A Buchstaller, R Huss, N Akis, D Schlondorff, HJ Anders. “Multipotent Mesenchymal Stem Cells Reduce Interstitial Fibrosis But Do Not Delay Progression of Chronic Kidney Disease in Collagen4A3-deficient Mice”, Kidney Int. 70, 121-9 (Ocak 2006)
    397
    ATIF
  • Feliers D, X Chen, N Akis, GG Choudhury, MP Madaio, BS Kasinath. “VEGF Regulation of Endothelial Nitric Oxide Synthase in Glomerular Endothelial Cells”, Kidney Int. 68, 1648-59 (Ocak 2005)
    129
    ATIF
  • Akis N, Madaio MP, ‘’Isolation, Culture, and Characterization of Endothelial Cells from Mouse Glomeruli’’, Kidney Int 65(6):2223-7 (Ocak 2004)
    104
    ATIF
  • Birebent, B., E. Mitchell, N. Akis, W. Li, R. Somasundaram, E. Purev, D. Hoey, M. Mastrangelo, H. Maguire, D. T. Harris, S. Nair, D. Cai, T. Zhang, D. M. Herlyn, “Monoclonal Anti-idiotypic Antibody Mimicking the Gastrointestinal Carcinoma-Associated Epitope CO17-1A Elicits Antigen-Specific Humoral and Cellular Immune Responses in Colorectal Cancer Patients“, Vaccine, 21, 1601-1612 (Ocak 2003)
    21
    ATIF
  • Akis N, C. Andl, D. Zhou, “A Mixed Hemadsorption Assay for Detection of Cell Surface Binding Anti-tumor Antibodies in Human Sera“, J Immunol Methods, 261, 119-127 (Ocak 2002)
    3
    ATIF

Yazılan Uluslararası Kitaplar veya Kitaplarda Bölümler

  • Herlyn, D., B. Birebent, N. Akis, E. Purev, R. Somasundaram, E. Mitchell, H. Maguire, L. Staib, M. Mastrangelo, “Colon Cancer Antigen and Anti-Idiotype Vaccines“, Cancer Chemotherapy & Biological Response Modifiers Annual 21, ed. G. Giaccone, R. Schilsky, P. Sondel, Vol. 21, 287-298, Elsevier B.V., Oxford (Ocak 2003)
    2
    ATIF

Ulusal Hakemli Dergilerde Yayınlanan Makaleler

  • Yurdakul S, N Akis, S Findik, “Transition to Adaptive Immunity”, Turkish Journal of Immunology, 11, 17-26 (Ocak 2006)
  • Akış N, O. Sayhan, A. Karaçavuş, K. Töreci, “Immunogenicity and Specificity of Salmonella typhimurium Outer Membrane Antigens“, J Cell Mol Biol, 2:91-96 (Ocak 2003)
    11
    ATIF
  • Türkoğlu S, A.P. Çamurdan, N. Akış, S. Badur, “İstanbul’da Rotavirus Çocuk Diyareleri Epidemiyolojisinin Virus Genom RNA’sı Elektroforezi ile Araştırılması“, Mikrobiyoloji Bulteni, 27, 93-99 (Ocak 1993)
    10
    ATIF
  • Akış N, S. Badur, “Enterobakteriler ile Olan İnfeksiyonlarda Enzim-immün-assay ile Özgül Antikor Aranması“, İnfeksiyon Dergisi, 4, 533-539 (Ocak 1990)
    1
    ATIF
  • Badur S, N. Akış, A. Öztoprak, G. Çelik, M. Bayık, N. Uras, “İstanbul'da Hayat Kadınları, Eşcinseller ve Hastane Çalışanlarında Hepatit B ve HIV İnfeksiyonları Prevalansı“, Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 16, 135-146 (Ocak 1986)
    23
    ATIF

Ulusal Konferans ve Sempozyumlar

  • BAŞKAN: TİD-İmmünoloji Okulu (2017) • • • KONUŞMACI: TİD-İO (2017). Ulusal İmmünoloji Kongresi (2007-2013). KMO-İŞ-Biyokimya Günleri (2011). TÜBİTAK-MAM-GMBEA Semineri (2004-2006). Haliç Üniv. MBG Bahar Semp. (2008) (Ekim 2017)

Yazılan Ulusal Kitaplar veya Kitaplarda Bölümler

  • N. Akış. Rotavirüs İmmünolojisi. Kitap: Viral İmmünoloji, Ed. ET Çetin. 1989, Anadolu Üniversitesi Basımevi, Eskişehir, s 51-57 (Ekim 1989)

Yönetilen Doktora Tezleri

  • İmmünoloji PhD Programı: Dilek Tiyekli, BSc, MA (Haziran 2016)
  • Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvar Uzmanlığı Programı: Demirhan Güven, MD (Nisan 2012)

Yönetilen Yüksek Lisans Tezleri

  • İmmünoloji MSc Programı: Behzat Hashemzadeh, BA (Ekim 2018)
  • Tıbbi Mikrobiyoloji MSc Programı: Samet Alboy, BSc (Ekim 2012)

Editörlük / Yayınlama

  • ORPHEUS/AMSE/WFME Task Force: Deckert J, Gordon D, Karle H, Lackovic Z, Lindgren S, Millan LM, et al. Standards for PhD Education in Biomedicine and Health Sciences in Europe. [Internet]. Available from, https://orpheus-med.org/wp-content/uploads/2021/11/ORPHEUS-AMSE-WFME-standards-for-PhD-education.pdf. Çev: Say A, Güç D, Tiyekli D, İlhan F, Araslı M, Akış N). Avrupa'da Biyotıp ve Sağlık Bilimlerinde PhD Eğitim Standartları. N Akış (ed). [Internet]. Zagreb, Hırvatistan: ORPHEUS; 2013 [9 Ocak 2024'de erişim]. Erişim için, https://orpheus-med.org/wp-content/uploads/2021/11/ORPHEUS-AMSE-WFME_tur.pdf (Biyotıp PhD ORPHEUS Standartlari.pdf aşağıda) (Ocak 2013)
  • N Akış. Klinik İmmunoloji Laboratuvar Föyleri. İstanbul Üniversitesi İmmünoloji Grubu Kitapçığı, İstanbul (Mayıs 1994)
  • Bağışıklık Bilimi Bülteni, Editör (1991-1996), İstanbul Üniversitesi İmmunoloji Lisansüstü Öğrenci Grubu ve Türk İmmünoloji Derneği Ortak Yayını, İstanbul >>> Türk İmmünoloji Dergisi, Yardımcı Editör (1996-2004) ve Danışma Kurulu Üyesi (2021-2022), Türk İmmünoloji Derneği Resmi Yayın Organı, İstanbul

Yapılan Hakemlikler

  • MAKALE: TMSJ (2023), TJI (2017-2021), Microbiological Research (2017), Balkan Medical Journal (2012-2014), JCMB (2004-2005) • • • HIBE: TÜBİTAK hakem-moderatör (2008, 2018, 2020-2022), Akdeniz Üniv BAP (2013), TÜBAP (2008).

Projeler

  • Yangılı ve İmmün Yetersizlikli Hastaların Kanında Sitotoksik CD4+ T Lenfositleri ve Stres Proteinlerinin Araştırılması (MSc eğitim ve tez danışmanı, TÜBAP) (Aralık 2019)
  • Endotel Hücrenin Farklı Diyabet Stresleri Altında Mononükleer Hücreleri Bağlama ve Koruyucu Genleri İfadeleme Yanıtları (PhD eğitim ve orijinal bilimsel araştırma danışmanı, TÜBAP) (Haziran 2016)
  • Controlling Atheroprotective Gene Expression by Controlling Expression of Its Specific miRNAs (Araştırma bursiyeri danışmanı, EFIS • • • Sabatikal bursiyeri, YÖK) (Şubat 2013)
  • Staphylococcus aureus‘un Vankomisin ve Metisiline Karşı Savunma Faktörlerinin Analizi (MSc eğitim ve tez danışmanı, TÜBAP) (Ekim 2012)
  • Salmonella’da Strese Yanıt Gen İfadelerinin Elektroforetik Tiplendirilmesi (Tıbbi Mikrobiyoloji Uzmanlık Programı tez danışmanı, TÜBAP) (Nisan 2012)
  • Salmonella typhimurium LT2'nin CRISPR repertoire (Yürütücü) (Şubat 2012)
  • Diyabetik Endotel Disfonksiyonunda Koruyucu Gen İfadesinin İncelenmesi (Postdoktoral bursiyeri eğitim ve araştırma danışmanı, TÜBİTAK) (Ocak 2010)
  • Yüksek Şeker ve İnsulin Konsantrasyonuna Maruz Kalan Endotel Hücrelerde Anti-apoptotik Yanıtın Floresan Mikroskopi ile İncelenmesi (Yürütücü: 2006 Haliç Ünv. BAP - 2015 TÜBAP) (Eylül 2006)
  • Molecular Mechanism of Renal Injury (Postdoctoral araştırmacı, NIH-RTG 5T32DK007006-29) • • • Molecular Mechanism of Renal Inflammation and Injury (Postdoctoral araştırmacı, NIH-CG 5P50DK045191-10) • • • Immunologic Mechanism of Lupus Nephritis (Postdoctoral araştırmacı, NIH-5RO1DK33694-18) (Eylül 2002)
  • Monoclonal Anti-idiotype Antibody Against Colorectal Cancer (Postdoktoral araştırmacı, NIH-3RO1CA060975-03S1; ve Postdoktoral bursiyer, NATO-TÜBİTAK-B1) • • • Recombinant Antigen Vaccines (Postdoktoral araştırmacı, CA010815; ve Postdoktoral bursiyer, NATO-TÜBİTAK-B1) (Mart 1998)
  • B Cell Differentiation in Ig Transgenic Mice (Postdoktoral araştırmacı, NIH-5RO1CA004946-35; ve Postdoktoral bursiyer, NATO-TÜBİTAK-B1) (Mart 1997)
  • Diyabet Anjiyopatisinde Bradikininin Endotel-Kan Hücreleri Etkileşimine Tesiri (PhD orijinal bilimsel araştırması, İst Üniv. BAP) (Eylül 1996)
  • Developing Anti-idiotypic Antibody, Which Mimics Receptor Binding Site of Hepatitis B Virus (Predoktoral öğrenci araştırma bursiyeri, Fransız Devlet Bursu) (Ağustos 1992)
  • S. typhimurium Dış Membran Proteinlerinin Antijenik Özelliklerinin ELISA ile İncelenmesi (MSc tezi, İst Tıp Fak. Mikrobiyoloji AD Fonu) (Eylül 1989)

Sertifikalar

  • Homogenous mouse glomerular endothelial (Penn Docket 02748-1), renal mesengial (Penn Docket 02748-2), and glomerular visceral epithelial (Penn Docket 02748-3) cell lines; University of Pennsylvania- Center for Technology Transfer, 2001, Philadelphia (Eylül 2001)

Diğer

  • --------------------------------------------------- SELECTED ABSTRACTS/ PROCEEDINGS ------- (makaleleşmemiş araştırma raporları, atıf değil)
    26
    ATIF

» Verdiği Dersler

Lisans MD Programı: İmmünobiyoloji, İmmün Fizyopatoloji

PhD ve MSc Programları (İmmünoloji, Tıbbi Mikrobiyoloji)

Tıbbi Mikrobiyoloji Uzmanlık Programı

» Duyurular

10 Mayıs 2015 » İmmünolojide Postdoktoral Eğitim